Prawidłowo zbudowana i prowadzona biogazownia nie jest szkodliwa dla ludzi ani środowiska. Wręcz przeciwnie – pomaga zmniejszyć emisję metanu, ogranicza uciążliwość zapachową odpadów rolniczych i poprawia gospodarkę nawozową. Ewentualne zagrożenia wynikają tylko z nieodpowiedniej obsługi lub złych zabezpieczeń.